استخراج اولتراسونیک عمدتاً در صنایع آبمیوه سازی و نوشیدنی برای استخراج مواد موثره مانند پکتین و رنگدانه های گیاهی استفاده می شود. ارتعاش اولتراسونیک می‌تواند دیواره‌های سلولی گیاه را بشکند و به پکتین، رنگدانه‌های گیاهی و سایر اجزای آن اجازه دهد تا به داخل شیره بروند. در همان زمان، اولتراسوند به کار خود ادامه می دهد تا ذرات پکتین و رنگدانه گیاهی را به ذرات کوچکتر پراکنده کند. این ذرات کوچکتر می توانند به طور یکنواخت و پایدارتر در آب میوه توزیع شوند. پایداری پکتین استخراج شده و تصفیه شده با اولتراسونیک به وضوح افزایش یافته است. تزریق آن به آب میوه ها و نوشیدنی ها می تواند از ته نشین شدن و لایه برداری آنها جلوگیری کند. رنگدانه های گیاهی استخراج شده و تصفیه شده توسط اولتراسونیک زنده تر است که می تواند به طور قابل توجهی رنگ آب میوه ها و نوشیدنی ها را بهبود بخشد.